隨著工業化技能的開展，包裝機械技能的不斷成熟與開展，廣泛應用于服裝、食物、藥品等多類職業領域，其中食物包裝對包裝職業又有了新的技能要求，無菌化包裝，這種包裝技能大大提高了食物的安全，而給袋式包裝機作為包裝職業中的一員，憑仗超卓的包裝技能和較高的生產率和受大客戶的喜愛。無菌化的包裝無疑成為給袋式包裝機新的包裝技能開展方向。
無菌包裝要求從食物經滅菌到無菌充填到包裝密封的整個工藝過程中避免外部微生物的侵入污染，食物流經的各個銜接部位要確保牢靠的密封，避免食物遭到來自體系外部的微生物污染，在無菌包裝過程中要充分留意微生物的二次污染，盡量縮短殺過菌的食物和包裝容器與空氣直接觸摸的時間。在食物包裝前，首要應對包裝機械及操作環境進行無菌處理。
包裝機械可用熱堿水洗滌，經稀鹽酸中和，熱水沖刷，再用高溫蒸汽滅菌。操作環境可采用化學滅菌和物理滅菌并用的辦法進行無菌處理， 一般無菌室設備有空氣過濾設備和紫外線滅菌設備，用以堅持無菌室經常性的無菌狀況。可定時地進行紫外線照耀以殺滅游離于空氣中的微生物。確保無菌室的潔凈度、溫度和濕度都應符合規定的標準（溫度一般控制在18攝氏度左右，濕度一般為55%左右）。
在運送過程中，要堅持接管處、閥門、熱交換器、均質機、泵等的密封性和體系內部堅持正壓狀況，以確保外部空氣不進入。一起要求運送線路盡可能簡略，以利于清洗。無菌包裝體系設備滅菌處理一般采用CIP原位清洗體系實施，可根據產品類型可按滅菌要求設定清洗程序。要在無菌操作環境中建立檢測設備以監控環境中微生物數量，確保包裝產品的無菌。
確保給袋式包裝機包裝封口無菌：包裝封口對無菌包裝來說是最后的環節，也是要害的一個環節，直接影響產品的包裝品質和儲存期。其要求是一方面是能避免微生物和氣體或水蒸氣侵入，另一方面是不能讓產品自身的氣味和原液溢出。大都
無菌包裝封口采用熱封、超聲波封、膠封或氣封，有些用折疊、咬合封口。
